在武汉初期，尤其是头一个月的时候，北京医院援鄂医疗队遇到了很多困难，主要表现是医疗防护物资缺乏，中法医院是新改建的医院，它的任务是收治1200个危重症病人，同时有十几家来自全国各地的医疗单位进驻这家医院，每天消耗的医疗防护物资是非常巨大的。另外，在抢救病人的过程中，因为来的都是危重症病人，人数很集中、很多，所以医疗队员会面临监测设备、抢救设备的缺乏。
如何解决这些困难？一是主要依靠中法医院，他们做了非常多的后勤保障工作，对医疗队提出的要求有求必应，付出了非常大的努力。二是医疗队去的时候也带了一些防护物资，也解决了部分燃眉之急，大后方给医疗队提供了很强大的支援，把最重要的防护物资提供给前线，这也保障了前线的工作人员的安全。
另外，针对监测和抢救物资的缺乏，北京医院援鄂医疗队从大后方抽调了一些物资，包括血气分析仪、有创无创呼吸机、床旁超声心动、高流量，把这些物资运到病房之后，大大提高了救治能力。三是社会捐赠给了医疗队很大帮助，有很多社会的热心朋友，捐助了很多氧饱和度监测仪、医疗物资、消毒用品，包括医务人员生活物资等。最紧张的时刻就是第一个月，因为还在春节期间，有很多工厂停工，很多物资比较紧张，但医疗队还是克服过来了。
